2023-09-29から1日間の記事一覧
fastp fastpは、アダプタートリミングとクオリティコントロールを同時に行う、高速なNGSデータ前処理パイプラインである。 fastqファイルに対応しており、fq.gzでもランが可能。 詳しくはfastpのgithubを参照 インストール condaによるインストールがシンプ…
cutadapt cutadapt はpythonで書かれたハイスループットシーケンシングリードからアダプター配列、プライマー、ポリA テールおよびその他のタイプの不要なシーケンスを検出して削除するプログラムである。 詳しくはこちらを参照 インストール condaによるイ…